在古印第安传说中，一直流传着神秘头骨的存在，在1492年哥伦布抵达美洲之前，印第安人统治着这里，事实上印第安人这种说法是欧洲人的误解，哥伦布以为自己到了印度。
印第安人在千年前就流传着一些关于宇宙的信息，它们的知识超越了人类的，而我们则处于另一个文明的控制之中。按照印第安人传说原版，太阳系中原来有12颗行星可居住，每一个头骨代表一个行星。
印第安古城遗址
头骨的材料为水晶制作而成，因此也被称为水晶头骨，古印第安人传说中指出如果把这些头骨集齐，就能够将所有的世界连通。
印第安人历史研究者雷德里维斯发现，在一些印第安人的遗址中也有水晶头骨的线索，其来自英国冒险家在1924年在危地马拉的发现，当时这里是一片古玛雅遗址。作为中美洲最重要的文明，玛雅遗址的年代还算是年轻的，古老的印第安人很早就通过白令海峡进入美洲大陆，并形成三大文明。
英国冒险家米切尔-黑吉斯在1920年代对英属洪都拉斯丛林进行考察，在与危地马拉接壤的丛林中找到了印第安人的遗址，这里曾经被喻为堕落石头之城，最终被烧毁。
水晶骷髅
米切尔-黑吉斯带了数十人对祭坛位置进行发掘，发现了水晶头骨，整个过程从定下方案到发现，一共经历了20多年。如今水晶头骨已经不见踪影，有评论指出，水晶头骨其实并非水晶打造，但使用了由早期印第安人提炼的金属，至于一些关于水晶头骨超自然的力量，也仅限于留言中。
